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mcu世界观的话，根据神盾局电视剧
九头蛇是一个在地球绵延已久的隐秘地下邪教，纳粹神盾局都是他们寄生的组织。九头蛇历史上喜欢找贵族和情报机构，因为有钱又隐秘又能接触超能物质。

创始原因是对史上第一个异人族“蜂巢”的崇拜。可以控制所有异人族。

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大约伊拉克的宗教遗迹时期就有九头蛇的痕迹了。

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蜂巢严格来讲应该是异人族创造者斯库鲁人控制异人的工具，是一群寄生虫的集合体。


九头蛇的目的就是释放被封印的蜂巢，后面目的就没了。

至于蜂巢有什么目的 他自己似乎不知道是被斯库鲁人创造的，本能大概是消灭人类把剩下的异人族变成自己的工蜂吧。

然后等斯库鲁人来收割？斯库鲁人制造异人族的目的电影里没说。漫画里是利用人类的潜力做星际战争的武器。