有个剧情介绍贴说明了两代之间的联系，大致就是外星人其实并非“外星人”，而是地球上最早的高智能生命体，从章鱼进化而来。然后发展出太空科技后就去外太空了，地球上留下了许多地下基地什么的，灵山有个，纽约海底下也有一个。2代里的那个躺在溶液灌里的老将军早就发现了这个秘密，利用搜集到的有限的这些外星人的科技开发了纳米服以防止外星人重返地球后面临的战争可能做准备。然后1代出发了章鱼人与外太空远征军的联系基地，等等~~~~大致如此
其实2代繁体中文版里都有交代，自己玩儿的时候仔细看看字幕就行了

打通了原来才发现，外星人根本就不是外星人。（剧透慎入）转
通篇剧情讲的其实是， 千万年前，地球上的章鱼进化了，成为了地球上第一个出现的智慧种族，等章鱼们的发展处太空科技后，不知什么原因全种族就离开地球了，只在地球上留守下了一个基地，和一个通讯站，并且封闭，留守人员也进入沉睡，为将来的回归做准备。
    NNN年后，猴子进化成了人类。一直到20世纪初的时候，有个叫哈格瑞夫的人发现了这个秘密（就是2代里的白发老头。），并且发现当初章鱼留下的那个基地其实就在美国纽约地下。 于是他成立了Crynet公司，开始研究章鱼科技，50年后，因为寿命原因，他利用章鱼科技将自己的身体冰冻，将意识和电脑联接以继续研究与控制公司的运作。终于在100年后研制出了**了章鱼和人类科技的“纳米服”。
    纳米服具有半生物半机械的特性。可以大幅度增加装备者的各项能力。且理论上其生物科技可以使纳米服真正的融入人体，修复身体组织，使其不再是一件衣服，而是变成“皮肤，内脏，骨骼”成为人体的一部分。某种意义上来说，就是使人类进化。 他认为只有人类获得这样的进化，才能在将来在章鱼有可能回归的情况下赢得生存空前， 并且哈格瑞夫自己也有私心，希望自己那衰败的身体 可以通过穿上纳米服后得到进化和修复，得以再次活过来。 可惜因为章鱼基地是被封闭的，人类科技无法打开，他得到的技术和样本非常的少，不足以使纳米服达到完美。只有最基本的功能，高端功能虽然预留了接口，但是缺少“硬件”而无法使用。
    终于在2023年的时候，太平洋上的灵山岛上突然出现了章鱼的通讯信号，一直没有被发现的章鱼通讯站被激活了，哈格瑞夫第一时间就发现了这个情况。 于是他认为机会和危机同时都到了，机会是，终于可以获得完整的资料来完善纳米服了。 但是同时 通讯站的恢复，也说明章鱼快要回归了。于是他把纳米服支援了美国军方，并让自己的特工（普费）混入了军方探查灵山岛的任务，其目的是为了进入基地取得样本和资料。(接下来就是1代的剧情了，至于朝鲜怎么会有纳米服的，就看游戏公司怎么圆这个故事了，我敢打赌，他们做一代的时候根本就没有考虑到二代的剧情。）
    普费在灵山岛进入了章鱼的通讯站后虽然取得了部分样本，但是却感染了章鱼时代的病毒孢子， 其实这种孢子并不是章鱼的生物武器， 就像哥伦布发现新大陆后，首先给本地土著带去的不是贸易，也不是战争，而是剧烈得的疾病一样。 人类的生态从没有接触过这种病毒，所以完全没有抵抗力，也没有产生抗体的的时间。
    普费通过章鱼通讯站 和基地之间的链接通道，直接从海底回到了纽约。 回归后的普费去质问哈格瑞夫关于其隐瞒了的病毒的情况（从过场中猜测可能赛可和诺曼也感染了病毒，普费形容为"行尸走肉”。）而哈格瑞夫却以“牺牲是必要的”论点来回应。普费怒而出走。并找到了另一个科学家“古德” 继续对纳米服中的章鱼技术 ，和病毒进行研究，以期找到对抗病毒和章鱼的方法。 不久，纽约地下的基地也开始复苏，全球气候受到能量的异常而变得恶劣。 3年后章鱼人破土而出，同时带出了病毒大规模感染了纽约的人类。也许章鱼认为人类是在自己睡着的时候霸占了家园的垃圾。于是战争爆发。（接2代剧情）
    普费因为感染达到极限，将纳米服交给了主角，同时为了断开和纳米服的意识链接而自杀。（其实突变进化了的纳米服已经将普费的思想融入了自己的计算机，在纳米服被进一步完善的过程中被一点一点的激活。）而2代一开始，哈格瑞夫为了复活自己，需要得到普费身上那套进入过章鱼基地被完善过的纳米服，而不停的追杀主角，然后又欺骗主角自投罗网。 在最后全部失败后，大彻大悟。将最后一部分完善纳米服的基因交给了主角，注射基因后，主角成为 反章鱼用人形毒气弹。进入章鱼的设施改变了孢子病毒的基因，使其对人类无害，反而成为章鱼的剧毒。并且释放出来。最终地球上留守的章鱼人没绝了。而主角则和纳米服包括普费的意识融合了。
    也许3代就要讲从太空回来的章鱼了，大概还会交代一下赛可和诺曼的事。
    这剧情谁想出来的，一个FPS整那么复杂。

自己玩儿的时候没看剧情么？那个老头子说了外星人本是地球的主人，回家来清理冰箱里的蟑螂
通古斯爆炸应该是章鱼人的一个地球基地爆炸，纳米服科技是从那里得来的
别上来就喷这喷那，牛逼你自己写个你自己理解的完整剧情概述。最起码人家这个是自己写的而不是YY的，许多剧情游戏里都有提到